Pour la jeune Mary Lennox, les jours heureux passés en Inde font désormais partie des souvenirs. Nous sommes en 1947, à la veille de la partition entre l’Inde et le Pakistan, et la fillette qui a déjà vécu la mort de sa mère voit disparaître dans la tourmente son père tant aimé.
Livrée à elle-même pendant un temps, elle est finalement secourue puis envoyée chez son oncle en Angleterre.
Changement radical de décors et d’ambiance : Mary qui vivait dans une grande maison illuminée de soleil et qui jusque-là avait l’habitude d’être servie, se retrouve dans un immense manoir austère, froid, figé et perdu dans la lande, sans grand monde à qui parler si ce n’est une gouvernante raide et directive.
Loin de se laisser abattre et frondeuse comme elle est, Mary s’en va explorer la vaste demeure et ses alentours.
Avec le concours d’un chien et d’un rouge-gorge, elle découvre au cœur du parc entourant le manoir, un merveilleux et mystérieux jardin caché derrière un grand mur et clos par une porte envahie par la végétation dont elle trouvera bientôt la clé.
Autre découverte de la fillette : son cousin Colin, cloué dans son lit par une étrange paralysie et cloîtré ainsi dans sa chambre depuis sa plus tendre enfance.
Avec Colin et Dickon, le fils d’une employée de la maison, Mary a enfin trouvé un peu de compagnie de son âge.
De leurs escapades et de leurs aventures ensemble naîtra une véritable amitié et surgiront quelques révélations…